課程名稱 |
新興模式生物發育功能基因體分析技術 Techniques for Developmental Functional Genomics of Emerging Model Organisms |
開課學期 |
107-1 |
授課對象 |
生命科學院 生命科學所 |
授課教師 |
郭典翰 |
課號 |
LS5081 |
課程識別碼 |
B21 U2250 |
班次 |
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學分 |
2.0 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期四6,7(13:20~15:10) |
上課地點 |
生科632 |
備註 |
總人數上限:10人 |
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1071LS5081_ |
課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程的授課對象是以非傳統之新興模式生物為研究對象的學生。近年來透過Evo-Devo研究以及基因體技術的應用,十八世紀以降發展出來的比較動物學在二十一世紀獲得一個嶄新的面貌。但也由於技術上的革命性發展,有志於比較動物學研究的學生在知識與技術的準備上,也面臨偌大挑戰。此課程的目的在於系統性地去介紹目前在非模式動物(或新興模式動物)的發育或功能性生物學研究常用的技術方法。主要課程內容包括: 公開取用基因體資料庫的使用、演化樹分析、功能性基因體分析、生物影像分析等。除正規上課之外,學生也要進行一個簡單的project,透過實作來達成有效的深化學習。課程前半將著重於基因體資料庫的應用,後半段則著眼於基因表現的功能性分析。 |
課程目標 |
1.熟悉以新興模式生物分析特定課題時可使用之軟體資源及工具。
2.了解以新興模式生物進行實驗時可用之取徑。
3.了解新興模式生物的優勢及限制。 |
課程要求 |
1.對開發或使用非傳統新興模式動物進行研究有興趣。
2.上課須自備筆記型電腦。 |
預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
待補 |
參考書目 |
較基礎介紹部分摘用教科書素材,較進階的部分則以原始期刊文獻為主。 |
評量方式 (僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
9/13 |
Introduction to the Course |
第2週 |
9/20 |
Genome Project I: Assembly |
第3週 |
9/27 |
Genome Project II: Annotation |
第4週 |
10/04 |
Mining Genomes: BLAST |
第5週 |
10/11 |
Mining Genomes: Special Cases (Non-Coding Sequences) |
第6週 |
10/18 |
Phylogenetic Analysis 1 |
第7週 |
10/25 |
Phylogenetic Analysis 2 |
第8週 |
11/01 |
Phylogenetic Analysis 3 |
第9週 |
11/08 |
Phylogenetic Analysis 4 |
第11週 |
11/22 |
Phylogenetic Analysis 5 |
第12週 |
11/29 |
Phylogenetic Analysis 6 |
第13週 |
12/06 |
Analysis of gene functions 1 |
第14週 |
12/13 |
Analysis of gene functions 2 |
第15週 |
12/20 |
Bioimaging 1 |
第16週 |
12/27 |
Bioimaging 2 |
第17週 |
01/03 |
Final Meeting |